芬蘭海關采用國際統一的HS制，大部分關稅是根據貨物的海關價值，以百分比按價征收的，有時可根據貨物的重量確定稅率。芬蘭的關稅稅率較低，大多數原料和飛機可免稅進口，大多數工業制成品的稅率一般為5-7%，但有些商品的稅率高達30-35%，如頭飾，玻璃器皿、服裝等。機械進口關稅稅率從0-15%。有些農產品進口須交特別進口費用或征稅，稅率隨該產品的世界市場價格而變化。

進口單證
一、商業發票。從海關提出進口貨物，須提供原始商業發票， 如要求更多的副本，進口商也應如數提供。商業發票須具備下列內容：進出口商的名稱和地址，開發票日期，貨物件數，饈類型，毛重和凈重，編號，貨物名稱，數量，單價和總價，有無折扣及折扣條件，交貨及支付條件，購買國和原產地，運輸方式等。另外，運費、保險費、廣告費、饈費等，也應在發票上標明。
二、原產地證書。如商品無產地樗，或從商標上無法辨認出產地，須提供原產地證書。原產地證書必須說明每件貨物的順序號和標記，貨物的毛重、凈重和貨物的性質及產地。原產地證書必須有一份經過簽署的商業發票。
三、提單。需要提供一份可議付的提單正本和按照收貨人要求提供的若干份副本。提單應具有發貨人名稱和地址，收貨人的名稱和地址，目稱和地址，收貨人的名稱和地址，目的港，貨物名稱，運費及其他費用，全套提單和頁數，貨物裝船后承運人正式收貨的日期和簽字等，并應與商業發票和貨物饈上的內容相一致。空運貨物應用空運提單。
四、衛生證書。對被懷疑可能帶有傳染性病菌進入芬蘭的動物或植物貨物，須提供衛生證書。此規定涉及的商品包括：鮮活植物、種子、植物環莖、鋸后木材、番茄、活動物、未加工的動物產品及大部分加工的動物產品。

入境與倉儲
一、入境。貨物在入境后15天內，不論是屬消費，倉儲，臨時入境，還是轉運其他入境地，都必須結關。結關時進口商或代理人須提供商業發票和報關單，價值在1000芬蘭馬克以上的貨物，要同時提交一份價值申報單。報關單須與進口的貨物相符，并說明貨物的應稅價值、關稅標題和數量。同時，還須提供運輸及保險單據。價值申報單和報關單，均須有報關人或指定代理人的簽字。未在規定期限內結關和繳納相應關稅和稅收的貨物，將被海關拍賣。
二、倉儲。芬蘭有三種類型的海關保稅倉庫：公用型倉庫、私營型倉庫和雜貨型倉庫。為輸清關、復出口或運往芬蘭其他入境地等手續，貨物可從這些倉庫中提走。貨物在存入這些倉庫前需經海關檢查，其程序依所使用的倉庫而有所不同。存入一般倉庫和過境倉庫的檢查比較簡單，只是在這些貨物從倉庫提走時才進行全面檢查；存入私營倉庫中的貨物事先須經詳細檢查，如復出口或運往芬蘭另一入境地時，海關要再次檢查。貨物可在公用和私營倉庫中儲存1年，特殊情況也可以延長儲存時間。在雜貨倉庫中貨物無存儲限期。

芬蘭自由港及海關管制
芬蘭唯一的自由港設在西南沿海的漢科，在圖爾庫、赫爾辛基、科特卡、拉彭蘭塔、奧魯和洛維薩等地設有自由貿易區。在漢科和赫爾辛基的自由貿易區，還設有保稅倉庫和國際集裝箱集散總站。進入自由區的貨物可進行儲存、重新饈、分類、混合等處置，或像在芬蘭境外的貨物一樣進行其他處理。如果獲芬蘭海關的特許，還可進行裝想和制造業務。芬蘭禁止進口的商品，未經海關允許不得進入自由港區。進入自由區的貨物不得展覽、出售或捐獻。
芬蘭海關規定，對舊船和國際上限制出口的商品，需要輸出口許可證。對小麥、裸麥、燕麥及部分糧食產品，由芬蘭國有公司或國家控制的組織負責進口。一般由出口商辦理出口許可證，進口商辦理進口許可證。有關全球配額許可證和單獨許可證的詳細情況，可向芬蘭進出口許可辦公室索取。